非法行醫立案的情形有非法行醫立案的情形有:(1)造成甲類傳染病傳播、流行或者有傳播、流行危險的;(2)造成就診人輕度殘疾、器官組織損傷導致一般功能障礙,或者中度以上殘疾、器官組織損傷導致嚴重功能障礙,或者死亡的;(3)非法行醫被衛生行政部門行政處罰兩次以後,再次非法行醫的;(4)其他情節嚴重的情形。