一、兩者的註冊資金不同：
1、商貿公司的註冊資金：最低註冊資本要求爲3萬；註冊資金比例最低註冊比例爲10%和90%。
2、有限公司的註冊資金：最低註冊資本要求爲10萬。
二、兩者的概述不同：
1、註冊商貿公司的概述：商貿有限公司的主要業務是商業，店鋪，商業的團體，貿易就是物流，商品的週轉，總的來說就是以店鋪爲中心的有關貨物銷售與週轉的有限責任公司。
2、有限公司的概述：有限責任公司，簡稱有限公司，中國的有限責任公司是指根據《中華人民共和國公司登記管理條例》規定登記註冊，由五十個以下的股東出資設立，每個股東以其所認繳的出資額爲限對公司承擔有限責任，公司法人以其全部資產對公司債務承擔全部責任的經濟組織。
三、兩者的優勢不同：
1、註冊商貿公司的優勢：
（1）首先，將註冊資本實繳登記制改爲認繳登記制。
（2）其次，放寬註冊資本登記條件。
（3）第三，簡化登記事項和登記檔案。
2、有限公司的優勢：
優點是設立程序比較簡單，不必發佈公告，也不必公佈賬目，尤其是公司的資產負債表一般不予公開，公司內部機構設定靈活。
法律依據：《公司法》。
