一、自然人公司股權轉讓要交哪些稅
個人轉讓公司股權必須繳納以下兩種稅：
1、印花稅。稅率按產權轉移書據稅目的萬分之五，計稅依據爲雙方書立的合同金額。
2、個人所得稅。稅率是固定的20%，重要的是要準確計算應納稅所得額。個人轉讓股權的應納稅所得額爲：股權轉讓價-股權取得初始成本-與轉讓股權相關的合理費用(如前文繳納的印花稅，以及可能發生的公證費。)
另，友情提醒，有些納稅人企圖透過雙方協商，簽訂低價合同以達到避稅目的，這不是合理避稅，這是偷逃稅，是違法行爲;況且也不可能得逞，低價轉讓股權必須符合法定情形。否則，稅務機關將按照每股淨資產或股權對應的淨資產份額覈定股權轉讓收入。稅法還規定對偷逃稅款處50%至五倍罰款。
二、辦理股權轉讓，需要去哪些部門辦理?
到工商部門辦理。個人應該去工商局辦理股權轉讓，需要提交變更登記申請書、轉讓的主體資格證明等材料。
轉讓股權需要召開新股東會議，經過新股東會表決同意，任命新股東的相關職務，表決比例和表決方式按照公司章程的規定進行;
參加會議的股東在《股東會決議》上簽字蓋章。討論新的公司《章程》，透過後在新的公司《章程》上簽字蓋章。
《公司法》第七十一條，有限責任公司的股東之間可以相互轉讓其全部或者部分股權。 股東向股東以外的人轉讓股權，應當經其他股東過半數同意。
股東應就其股權轉讓事項書面通知其他股東征求同意，其他股東自接到書面通知之日起滿三十日未答覆的，視爲同意轉讓。
其他股東半數以上不同意轉讓的，不同意的股東應當購買該轉讓的股權;不購買的，視爲同意轉讓。 經股東同意轉讓的股權，在同等條件下，其他股東有優先購買權。
兩個以上股東主張行使優先購買權的，協商確定各自的購買比例;協商不成的，按照轉讓時各自的出資比例行使優先購買權。 公司章程對股權轉讓另有規定的，從其規定。
股權交易各方在簽訂股權轉讓協議並完成股權轉讓交易以後至企業變更股權登記之前，負有納稅義務或代扣代繳義務的轉讓方或受讓方，應到主管稅務機關辦理納稅(扣繳)申報，並持稅務機關開具的股權轉讓所得繳納個人所得稅完稅憑證或免稅、不徵稅證明，到工商行政管理部門辦理股權變更登記手續。
