根據《公司登記管理條例》的相關規定，公司變更股東的，應當按照以下程序進行。首先，公司應當向登記機關提交相關檔案，包括公司法定代表人簽署的變更登記申請書、依照《公司法》作出的變更決議或者決定、新股東的主體資格證明或者自然人身份證明以及國家工商行政管理總局規定要求提交的其他檔案。其次，公司應當在變更股東之日起三十日內申請變更登記。《公司登記管理條例》第二十七條《公司登記管理條例》第三十四條
