公司變更股東，本質上屬於股權轉讓行爲。依據《國家稅務總局關於企業股權投資業務若干所得稅問題的通知》，自然人股權轉讓行爲，轉讓方需要按“財產轉讓所得”計徵個人所得稅。因此，股權轉讓方應當將收益部分的20%繳納個人所得稅。即：以轉讓股權的收入額減除原值和合理費用後的餘額，適用百分之二十的比例稅率，計算繳納個人所得稅。但是，如果轉讓方以原價轉讓的，不交個人所得稅。
