二手房合同無效但其違約條款仍有效。因爲民事法律行爲部分無效，不影響其他部分效力的，其他部分仍然有效。但是民事法律行爲無效、被撤銷或者確定不發生效力後，行爲人因該行爲取得的財產，應當予以返還；不能返還或者沒有必要返還的，應當折價補償。
《民法典》 第一百五十六條 民事法律行爲部分無效，不影響其他部分效力的，其他部分仍然有效。
第一百五十七條 民事法律行爲無效、被撤銷或者確定不發生效力後，行爲人因該行爲取得的財產，應當予以返還；不能返還或者沒有必要返還的，應當折價補償。有過錯的一方應當賠償對方由此所受到的損失；各方都有過錯的，應當各自承擔相應的責任。法律另有規定的，依照其規定。
