協議離婚後，如果發現存在共同財產糾紛，具體有以下幾種處理方法：
一、雙方協議重新簽訂離婚協議或者簽訂補充協議去婚姻登記處備案。
二、協議不成，可以去法院起訴申請對未分割財產進行分配。若因爲一方故意隱瞞、轉移、變賣夫妻共同財產導致漏分，對於故意隱瞞、轉移、變賣一方應少分或不分財產。
法律依據
《民法典》第1092條，夫妻一方隱藏、轉移、變賣、毀損、揮霍夫妻共同財產或者僞造夫妻共同債務企圖侵佔另一方財產，在離婚分割夫妻共同財產時，對該方可以少分或者不分。離婚後，另一方發現有上述行爲的，可以向人民法院提起訴訟請求再次分割夫妻共同財產。
