對於男女雙方非法同居期間所生子女由哪一方撫養的問題，最好由雙方協商解決。在無法協商或者協商不成的情況下，可以到法院起訴，法院會根據子女的利益及雙方的具體情況予以判決。哺乳期內的子女，原則上由女方撫養；如果父方條件較好，母方也同意的，也可以交由父方撫養。當子女爲10週歲以上不滿18週歲的的限制民事行爲能力人時，由哪一方撫養，應徵求子女本人的意見。
《民法典》第一千零八十四條 父母與子女間的關係，不因父母離婚而消除。離婚後，子女無論由父或者母直接撫養，仍是父母雙方的子女。
離婚後，父母對於子女仍有撫養、教育、保護的權利和義務。
離婚後，不滿兩週歲的子女，以由母親直接撫養爲原則。已滿兩週歲的子女，父母雙方對撫養問題協議不成的，由人民法院根據雙方的具體情況，按照最有利於未成年子女的原則判決。子女已滿八週歲的，應當尊重其真實意願。
