運輸增值稅發票有4%、6%、13%、17%的稅率，一般納稅人取得增值稅發票可抵扣相應稅額，小規模納稅人和一般納稅人開具增值稅票都要交相應的稅額。普通發票也有4%、6%、13%、17%稅率，無論小規模納稅人還是一般納稅人取得普通發票都不能抵扣，小規模納稅人和一般納稅人開具普通發票都要交相應的稅額。
有下列情形之一者，應按銷售額依照增值稅稅率計算應納稅額，不得抵扣進項稅額，也不得使用增值稅專用發票：(一)一般納稅人會計覈算不健全，或者不能夠提供準確稅務資料的;(二)除本細則第二十九條規定外，納稅人銷售額超過小規模納稅人標準，未申請辦理一般納稅人認定手續的。
