兩者的區別在於：
1、是否需要建立個人帳戶。一檔不建立個人帳戶，二檔要建立個人帳戶；
2、一檔是屬於原綜合醫療，二檔是屬於住院醫療。
3、計算方式不一樣。一檔的計費方式是：工資乘以8.2%，然後公司承擔6.2%，個人承擔2%。二檔是用6054乘以0.8%，公司承擔0.8%，個人承擔0.2%，另外，二檔的個人帳戶資金以上年度本市城鎮經濟單位職工年平均工資爲基數，按以下比例劃入：不滿35週歲的人員，劃入比例爲3.3%；滿35週歲至不滿45週歲的人員，劃入比例爲3.5%滿45週歲未達到法定退休年齡的人員，劃入比例爲3.7%；達到法定退休年齡的人員，繳費期內劃入比例爲4%，繳費期滿後劃入比例爲上年度本市城鎮經濟單位職工年平均工資的60%的4%。
法律依據：
《社會保險法》第十條
職工應當參加基本養老保險，由用人單位和職工共同繳納基本養老保險費。
無僱工的個體工商戶、未在用人單位參加基本養老保險的非全日制從業人員以及其他靈活就業人員可以參加基本養老保險，由個人繳納基本養老保險費。
公務員和參照公務員法管理的工作人員養老保險的辦法由國務院規定。
