醫保用戶在住院手續的時候要到醫保定點醫院，使用醫保卡（有些地區是醫儲存摺、醫療手冊等），該個人出的部分由個人出，該醫保報銷的部分不需要個人先行墊付，醫院在結算時直接扣掉了，由醫院和醫保中心結算。新農合用戶要門診就診卡→掛號就診→門診醫生開住院證→入院處住院手續（持轉診轉院審批表、患者當年參合證、身份證、戶口本、外傷患者需出示村公所開具的外傷證明）。患者出示醫保合療證件、轉診審批表和身份證、合療本，醫保合療覈對患者姓名、性別、年齡、證件等資訊，符合條件給予入院醫保合療登記手續。不符條件的按自費。
法律依據：《中華人民共和國社會保險法實施細則》
第八條 參保人員在協議醫療機構發生的醫療費用，符合基本醫療保險藥品目錄、診療項目、醫療服務設施標準的，按照國家規定從基本醫療保險基金中支付。參保人員確需急診、搶救的，可以在非協議醫療機構就醫;因搶救必須使用的藥品可以適當放寬範圍。參保人員急診、搶救的醫療服務具體管理辦法由統籌地區根據當地實際情況制定。
