因爲公訴轉自訴原本就是屬於公訴案件，反訴程序裏面檢察院是不能做被告的。公訴轉自訴案件其實是對公安機關，檢察院行爲的一種審查，是一種監督糾錯機制，它本質上仍是公訴案件，不可以反訴，只不過賦予了被害人自訴的救濟權利，因此是不允許調解的，除了民事賠償部分。但是根據法律相關規定，可以進行和解。公訴轉自訴案件可以和解。
【法律依據】
《刑事訴訟法》第一百八十條
對於有被害人的案件，決定不起訴的，人民檢察院應當將不起訴決定書送達被害人。被害人如果不服，可以自收到決定書後七日以內向上一級人民檢察院申訴，請求提起公訴。
