1.刑事案件是指刑法所保護的社會關係受到了侵害。
而行政案件是指國家行政機關的行政行爲違法或不當。
2.刑事案件要追究犯罪嫌疑人的刑事責任，進而立案偵查、審判，並給予罰金、有期徒刑、無期徒刑、死刑等刑事處罰。
而行政案件則是依照《行政訴訟法》規定的程序起訴，由法院來立案處理行政上的爭議，確認、撤銷或變更行政行爲。
3.刑事案件中，當事人是公訴機關或自訴人、被告人、被害人。
在行政案件中，原告是公民或組織，被告是行政機關。
並且行政機關是不可以起訴公民或組織的。法律依據：《行政訴訟法》第二條
公民、法人或者其他組織認爲行政機關和行政機關工作人員的行政行爲侵犯其合法權益，有權依照本法向人民法院提起訴訟。
前款所稱行政行爲，包括法律、法規、規章授權的組織作出的行政行爲。
