1、概念上的區別。
醫療事故是指醫療機構及其醫務人員在醫療活動中，違反醫療衛生管理法律、行政法規、部門規章和診療護理規範、常規，過失造成患者人身損害的事故。醫療過錯是指醫療事故以外，由於醫院的過錯，造成患者人身傷害的過錯。
2、醫療事故與醫療過錯在適用法律上存在差異，從而在鑑定、賠償數額等存在明顯不同。
前者主要依據國務院頒佈的醫療事故處理條例，後者主要適用最高人民法院關於審理人身損害賠償。醫療事故的鑑定機構是醫學會，醫療過錯的鑑定機構是司法鑑定機構。按照醫療事故賠償所得要低於按照醫療過錯賠償所得。由於醫療事故鑑定被限定在糾紛醫院所在地的醫學會，鑑定的專家和糾紛涉及的醫院有千絲萬縷的聯繫，被認爲是兄弟之間的鑑定，鑑定專家不需對鑑定結果承擔任何責任，所以其鑑定的公正性被廣泛質疑。醫療過錯的鑑定機關沒有地域限制，且鑑定人員爲法醫，鑑定人員對鑑定結果負責，鑑定相對公正，曾經有統計，在不被鑑定爲醫療事故的醫療侵權中，有70%以上被鑑定爲醫療過錯。
之所以出現醫療事故與醫療過錯的區分，除了與目前法制現狀有關外，很重要的原因與目前醫療事故鑑定缺乏公正有直接的聯繫。由於醫療侵權的特殊性、複雜性，此二元制的現象將在很長一段時間持續存在。
3、關於醫療事故與醫療過錯的關係，人民法院在審理醫療糾紛案中應當處理好《民法典》與《醫療事故處理條例》之間的關係。
對於鑑定機關認定不構成醫療事故，但在審理中有證據能夠認定醫療機構確實存在過錯，應當根據《民法典》關於過錯責任的認定，確定醫療機構應當承擔的責任。
4、醫療事故鑑定與司法鑑定的關係。在醫療事故糾紛處理過程中往往涉及多個鑑定，以至重複鑑定。
對此，根據最高法院《關於參照〈醫療事故處理條例〉審理醫療糾紛民事案件的通知》的規定，在訴訟中，交由醫學會組織鑑定。對不構成醫療事故，當事人要求對醫療機構的過錯以及傷殘等級進行鑑定的，按照《人民法院對外委託司法鑑定管理規定》組織鑑定。
針對於醫療事故和醫療糾紛在處理的方法上面，首先，雙方應該保持理性的態度，尊重科學，並且配合相關部門的調查。調查結果出來之後，如果認爲不滿意的，可以再次選擇申請調查，如果雙方協商不下的話，可以透過法律訴訟的途徑來解決問題。
