遇到拆遷協議有糾紛可以申請由同級拆遷管理部門裁決，裁決後當事人仍不滿意的，可以向法院起訴。針對不同的事由，被拆遷人作爲原告的，可以採取起訴手段，運用法律的武器保障自己的合法權益；拆遷人作爲原告的，可以依法申請人民法院先予執行或強制執行。
《民事訴訟法》
第二百三十一條 發生法律效力的民事判決、裁定，以及刑事判決、裁定中的財產部分，由第一審人民法院或者與第一審人民法院同級的被執行的財產所在地人民法院執行。
法律規定由人民法院執行的其他法律文書，由被執行人住所地或者被執行的財產所在地人民法院執行。
1、房屋主體架構以及房屋內的裝潢、裝修及其他附屬物的補償
這是房屋拆遷補償的主要內容，其補償的金額，根據被拆遷房屋的區位、用途、建築面積等因素，以房地產市場評估價格確定。由於具體辦法是由省、自治區、直轄市人民政府制定的，各地操作起來會有所不同。
2、臨時安置補助費
拆遷人應當提供符合國家質量安全標準的房屋，用於拆遷安置。在過渡期限內，被拆遷人或者房屋承租人自行安排住處的，拆遷人應當支付臨時安置補助費；被拆遷人或者房屋承租人使用拆遷人提供的週轉房的，拆遷人不支付臨時安置補助費。因拆遷人的責任延長過渡期限的，對自行安排住處的被拆遷人或者房屋承租人，應當自逾期之月起增加臨時安置補助費；對週轉房的使用人，應當自逾期之月起付給臨時安置補助費。
3、搬遷補助費
其中，拆遷住宅房屋的，搬遷補助費根據原住房建築面積和規定的補助標準計算。但如果是拆遷人負責搬遷的，拆遷人不再支付搬遷補助費。拆遷非住宅房屋的，搬遷補助費還包括：設備搬遷、安裝的費用以及無法恢復使用的設備按照重置價結合成新結算的費用。
拆遷協議一旦簽訂就會產生法律效力，如果拆遷方不履行協議的條款，那麼被拆遷方是可以向拆遷管理部門投訴，或者是走法律的程序來進行解決，不管是走哪一種方式都需要有合法的證據來證明自己的觀點，這樣才能更好的保障到自己的勝訴機率。
