机关单位根据涉密信息系统的什么确定系统的密级

机关单位应当根据涉密信息系统存储、处理信息的最高密级确定系统的密级。
法律依据：
《中华人民共和国保守国家秘密法》第四条
保守国家秘密的工作（以下简称保密工作），实行积极防范、突出重点、依法管理的方针，既确保国家秘密安全，又便利信息资源合理利用。法律、行政法规规定公开的事项，应当依法公开。