一、合作社虧損申請破產該怎麼走程序?
合作社虧損申請破產，應當由法定破產申請人提出申請，人民法院受理破產申請並依法裁定後宣告破產，並組織成立依照有關法律，組織有關機關及有關專業人員成立清算組，對合作社進行破產清算。
根據《農民專業合作社法》第四十八條規定，農民專業合作社破產適用《企業破產法》的有關規定。但是，破產財產在清償破產費用和共益債務後，應當優先清償破產前與農民成員已發生交易但尚未結清的款項。
上述規定是對合作社破產財產優先清償順序的規定，體現了對農民成員權益的特殊保護，包含兩層意思：一是，農民專業合作社的破產財產在清償破產費用和共益債務後，應當優先清償破產前與農民成員已發生交易但尚未結清的款項。
享有優先受償權的只限於農民成員。
二、合作社虧損處理方式
1、在建工程部分發生報廢或者毀損，按規定程序批准後，按照 扣除殘料價值和過失人及保險公司賠款後的淨損失，計入工程成本。由於自然災害等非常原因造成的報廢或者毀損， 其淨損失計入其他支出。
2、建立健全固定資產內部控制制度，建立人員崗位責任制。應 當定期盤點清查固定資產，做到賬實相符，年度終了前必須進行一次 全面的盤點清查。 盤盈的固定資產，按同類設備的市價計入其他收入; 盤虧及毀損的固定資產，應查明原因，按規定程序批准後，按其原價 扣除累計折舊、變價收入、過失人及保險公司賠款之後，計入其他支出。
3、每年年度終了，合作社應當對短期投資、應收賬款、存貨、 農業資產、長期投資、固定資產、在建工程、無形資產等資產進行全面檢查，對於已發生損失但尚未批准覈銷的各項資產，應在資產負債 表補充資料中予以披露。這些資產包括：
①、確實無法回收的應收款 項;
②、無法回收的短期投資和長期投資;
③、盤虧、毀損或報廢的 存貨;
④、死亡、毀損的農業資產;
⑤、盤虧或毀損的固定資產;
⑥、 毀損或報廢的在建工程;
⑦、註銷或無效的無形資產。
4、加強應付賬款和其他應付款的管理，及時覈對餘額，保證負 債的真實性和準確性。凡一年以上應付而未付的款項應查找原因，對確實無法付出的應付款項報合作社總經理批准後處理。
綜上所述，合作社虧損嚴重無力償還債務時，申請賠償的程序適用於企業破產司法程序，通常包括提出破產申請，人民法院受理破產申請並進行裁定，組織成立破產清算組並進行資產清算和債務清償。
