透過研究國家稅務總局的《通知》《規定》《辦法》，現在歸納如下：
一、營業稅不用繳
根據財政部、國家稅務總局《關於股權轉讓有關營業稅問題的通知》(財稅〔2002〕191號)“股權轉讓行爲不徵收營業稅”的規定，直系親屬間股權轉讓不繳納營業稅。
二、個人所得稅最複雜
《個人所得稅法》及其實施條例的規定，對於自然人股東取得股權轉讓所得，應按“財產轉讓所得”項目徵收個人所得稅，適用稅率爲20%。財產轉讓所得以個人每次轉讓財產取得的收入額減除財產原值和合理費用後的餘額爲應納稅所得額。即具體計稅公式爲：應納稅所得額=財產轉讓收入-財產原值-轉讓中發生的合理費用;應繳個人所得稅=應納稅所得額×20%。
例如5%的股份，對應註冊資本(200萬)原值是10萬元，但是現在公司淨資產是5000萬，5%就是250萬元，則應納稅所得額是(250-10)×20%=48萬元。這麼高額的稅負每個正常的市場主體都不願意繳納，所以有限公司的股東之間轉讓股份往往都是平價或者低價轉讓，沒有財產轉讓收入，也就是避免出現應納稅所得。
針對這種“合理避稅”，有一系列檔案相繼出臺。
2009年，國家稅務總局出臺《關於加強股權轉讓所得徵收個人所得稅管理的通知》規定，股權交易各方在簽訂股權轉讓協議並完成股權轉讓交易以後至企業變更股權登記之前，負有納稅義務或代扣代繳義務的轉讓方或受讓方，應到主管稅務機關辦理納稅(扣繳)申報，並持稅務機關開具的股權轉讓所得繳納個人所得稅完稅憑證或免稅、不徵稅證明，到工商行政管理部門辦理股權變更登記手續。
2010年，《國家稅務總局關於股權轉讓所得個人所得稅計稅依據覈定問題的公告》，首次明確“計稅依據明顯偏低且無正當理由的，主管稅務機關可採用本公告列舉的方法覈定股權轉讓所得。”也就是說有不有股權轉讓所得不是股權的轉讓方、受讓方雙方自己說了算，而是要按照公平交易價格計算，確定計稅依據的權利在於稅務局。
2014年，國家稅務總局針出臺《股權轉讓所得個人所得稅管理辦法(試行)》第十一條：申報的股權轉讓收入明顯偏低且無正當理由的，主管稅務機關可以覈定股權轉讓收入。
哪些情況視爲股權轉讓收入明顯偏低?
1、申報的股權轉讓收入低於股權對應的淨資產份額的。其中，被投資企業擁有土地使用權、房屋、房地產企業未銷售房產、知識產權、探礦權、採礦權、股權等資產的，申報的股權轉讓收入低於股權對應的淨資產公允價值份額的;
2、申報的股權轉讓收入低於初始投資成本或低於取得該股權所支付的價款及相關稅費的;
3、申報的股權轉讓收入低於相同或類似條件下同一企業同一股東或其他股東股權轉讓收入的;
4、申報的股權轉讓收入低於相同或類似條件下同類行業的企業股權轉讓收入的;
5、不具合理性的無償讓渡股權或股份;
6、主管稅務機關認定的其他情形。
對於直系親屬間的股權轉讓是否繳納個稅，國務院財稅部門尚無明確規定，但是在法律之中開了人性的一道窗：“繼承或將股權轉讓給其能提供具有法律效力身份關係證明的配偶、父母、子女、祖父母、外祖父母、孫子女、外孫子女、兄弟姐妹以及對轉讓人承擔直接撫養或者贍養義務的撫養人或者贍養人”可以作爲股權轉讓收入偏低的正當理由。明確界定將股權轉讓給配偶、父母、子女、祖父母、外祖父母、孫子女、外孫子女、兄弟姐妹以及對轉讓人承擔直接撫養或者贍養義務的撫養人或者贍養人，屬於計稅依據明顯偏低的正當理由。
如果轉讓方計稅依據明顯偏低，低到“零”的程度，則構成直系親屬間股權無償轉讓或贈予，不需要繳納個人所得稅。直系親屬之間透過無償讓渡方式取得股權，按取得股權發生的合理稅費與原持有人的股權原值之和確認股權原值;
儘管直系親屬間股權贈予不需要繳個稅，但納稅人也需要注意稅務機關的徵管規定。稅務機關建立建立股權轉讓個人所得稅電子臺賬，將個人股東的相關資訊錄入徵管資訊系統，強化對每次股權轉讓間股權轉讓收入和股權原值的邏輯審覈，對股權轉讓實施鏈條式動態管理。
有些地區對無償轉讓股權行爲作出了規定：對於繼承、遺產處分、直系親屬之間無償贈予股權的情況，對當事雙方不徵收個人所得稅。納稅人需要提供公證機構出具的贈與人和受贈人親屬關係的公證書、撫養關係或贍養關係公證書(或鄉鎮政府或街道辦事處出具的撫養關係或贍養關係證明)、《繼承公證書》等相關證明，並填寫提交《個人股東變動情況報告表》，稅務部門應認真審覈並留存複印件。
三、印花稅
依據《印花稅暫行條例》的規定，在中華人民共和國境內書立、領受本條例所列舉憑證的單位和個人，都是印花稅的納稅義務人，應當繳納印花稅。簽訂股權轉讓書據應按“產權轉移書據”貼花，稅率爲0.5%。因此，直系親屬在股權轉讓中以股權面值爲計稅依據，按照0.5%的稅率計算繳納印花稅。未上市公司股權轉讓所書立的書據，按照產權轉移書據繳納印花稅。
直系親屬股權轉讓協議是現在很常見的一種合同形式，它涉及到資產的轉移、稅費的繳納等等，其中，營業稅、個人所得稅、印花稅更是常見，如果您生活中涉及這一方面，則有必要了解直系親屬股權轉讓的相關知識，以省去不必要的麻煩。以上是小編的整理，希望對你有所幫助。
