分公司簽訂合同和總公司在性質上是一樣的。分公司籤的合同和總公司籤的合同在法律性質上完全是一樣的，就是說合同的內容只要符合法律規定就受到保護。合同無效的原因不會是因爲籤合同的主體是分公司，關鍵是和分公司合作的項目，本來就應該和分公司籤合同，分公司有籤合同的權利。
法律依據：《最高人民法院關於適用中華人民共和國民事訴訟法若干問題的意見》 第四十條
民事訴訟法第四十九條規定的其他組織是指合法成立、有一定的組織機構和財產，但又不具備法人資格的組織，包括：（1）依法登記領取營業執照的私營獨資企業、合夥組織；（2）依法登記領取營業執照的合夥型聯營企業；（3）依法登記領取我國營業執照的中外合作經營企業、外資企業；（4）經民政部門覈准登記領取社會團體登記證的社會團體；（5）法人依法設立並領取營業執照的分支機構；（6）中國人民銀行、各專業銀行設在各地的分支機構；（7）中國人民保險公司設在各地的分支機構；（8）經覈准登記領取營業執照的鄉鎮、街道、村辦企業；（9）符合本條規定條件的其他組織。
