不一樣的，免予刑事處罰和不起訴的主要區別有：性質不同，免予刑事處罰是針對的對象是已經構成犯罪，但犯罪情節輕微不需要判處刑罰的人;不起訴的對象則包括不構成犯罪、指控犯罪證據不足或存疑、犯罪情節輕微,依照刑法規定不需要判處刑罰或者免除刑罰的人。作出機關不同，免予刑事處罰由法院作出，而不起訴決定則由檢察院作出。
法律依據：《刑事訴訟法》 第一百七十五條
人民檢察院審查案件，可以要求公安機關提供法庭審判所必需的證據材料;認爲可能存在本法第五十六條規定的以非法方法收集證據情形的，可以要求其對證據收集的合法性作出說明。人民檢察院審查案件，對於需要補充偵查的，可以退回公安機關補充偵查，也可以自行偵查。
