二級醫療事故的賠償金額要根據實際情況來計算。一般包括醫療費、誤工費、住院伙食補助費、陪護費、殘疾生活補助費、殘疾用具費、喪葬費、交通費和精神損害賠償等。二級甲等醫療事故爲二級傷殘,賠償指數90%;二級乙等醫療事故爲三級傷殘,賠償指數80%;二級丙等醫療事故爲四級傷殘,賠償指數70%;二級丁等醫療事故爲五級傷殘,賠償指數60%。