被告人有一套小產權房，法院不能強制執行。因爲小產權房屋是非法的，法院如果查封、拍賣，就會使非法的變成合法的，會使所有的小產權房屋都會透過法院的訴訟程序來合法化。根據《中華人民共和國土地管理法》第十一條農民集體所有的土地依法屬於村農民集體所有的，由村集體經濟組織或者村民委員會經營、管理；已經分別屬於村內兩個以上農村集體經濟組織的農民集體所有的，由村內各該農村集體經濟組織或者村民小組經營、管理；已經屬於鄉（鎮）農民集體所有的，由鄉（鎮）農村集體經濟組織經營、管理。
