小產權房在本質上仍然屬於違法建築。
政府將其進行拆除屬於行使行政職權。
若涉及集體土地徵收問題，會給集體組織徵地補償。
但對於房屋使用人無賠償。
法律依據
《國有土地上房屋徵收與補償條例》第二十四條
市、縣級人民政府及其有關部門應當依法加強對建設活動的監督管理，對違反城鄉規劃進行建設的，依法予以處理。
市、縣級人民政府作出房屋徵收決定前，應當組織有關部門依法對徵收範圍內未經登記的建築進行調查、認定和處理。
對認定為合法建築和未超過批准期限的臨時建築的，應當給予補償；對認定為違法建築和超過批准期限的臨時建築的，不予補償。
