區分重大環境污染事故罪與環境監管失職罪兩罪同屬結果犯的範疇，都是由於其行爲造成了重大環境污染事故，致使嚴重後果的發生，且主觀上都含有過失的罪過形式，個別情況下也存在着故意形態，但主要是間接故意。
兩罪的主要區別：
1.客體不同。本罪客體是國家環境保護和環境污染防治的管理制度，屬於破壞環境資料的犯罪。而後罪侵犯的客體則爲國家對環境保護工作的正常管理活動，屬於瀆職犯罪。
2.客觀方面不同。本罪表現爲違反國家規定，向土地、水體、大氣排放危險廢物，嚴重污染環境。而環境監管失職罪表現爲環境保護部門的國家機關工作人員的嚴重不負責任，從而造成重大環境污染事故，這種嚴重不負責任主要體現爲濫用職權和玩忽職守，不盡職責的行爲。
3.主體不同。本罪的主體既可以是自然人，也可以是單位，對自然人作爲本罪的主體沒有限制條件，而後罪的主體是特殊主體，即負責環境保護監管職責的國家機關工作人員，單位不構成該罪主體。
