1.定義不同：軟件著作權是指軟件的開發者或者其他權利人依據有關著作權法律的規定，對於軟件作品所享有的各項專有權利。專利是由政府機關或者代表若干國家的區域性組織根據申請而頒發的一種檔案，獲得專利的發明創造在一般情況下他人只有經專利權人許可才能予以實施。
2.法律依據不同：軟件著作權保護主要依據《著作權法》和《計算機軟件保護條例》，專利的保護主要依據《專利法》、《中華人民共和國知識產權法》。
3.申請方式不同：軟件著作權寫完就自然受到保護，不需要經過審覈，提交材料符合規範就可以獲得。專利需要經過形式審查和實際審查，要滿足新穎性、創造性、實用性等諸多要求，才能夠受到保護。
4.簡易程度不同：軟件著作權獲權簡單，維權簡單，保護力度弱，產生的效益通常是收取授權費用。專利獲權困難，維權複雜，保護力度強，產生的效益大而且持久。
著作權屬
1.透過登記機構的定期公告，可以向社會宣傳自己的產品。
2.在進行軟件版權貿易時，認證將使您的軟件作品價值倍增。
3.在發生軟件著作權爭議時，如果不經登記，著作權人很難舉證說明作品完成的時間以及所有人。
4.合法在我國境內經營或者銷售該軟件產品，並可以出版發行。
5.在進行軟件產品登記的時候可以作爲自主知識產權的證明材料。
6.在進行軟件企業認定和高新技術企業認定時可以作爲自主開發或擁有知識產權的軟件產品的證明材料。
專利制度宗旨
專利制度旨在保護技術能夠享受到獨佔性、排他性的權利，權利人之外的任何主體使用專利，都必須透過專利權人的授權許可才能獲得使用權。
隨着法律制度的不斷完善，專利的使用呈現出多樣化趨勢，專利無效、專利撤銷、過期專利等一一被列入專利法律範疇。只有充分的認識諸如此類的法律制度，才能充分的利用專利資源，爲企業實現更多的經濟價值。
涉及到軟件開發等相關問題，都是屬於軟件著作權，而涉及到相關發明或者是創造纔是屬於專利權，軟件開發是不能夠申請專利的，只能夠向相關部門進行申請軟件著作權，如果他人需要使用到該軟件的相關程序必須透過著作權人同意才能使用。
