1、在權利主體方面，著作權的主體既可以是公民個人，也可以是法人或非法人單位;既可以是作者本人，也可是其繼承人或其權利義務的承受人，有時還可以是國家。商標權的主體主要是法人，公民個人如在我國申請註冊商標，則必須是個體工商業者。國家不能成爲商標權的主體。
2、在權利的取得方面，著作權的取得一般爲自動產生，商標權的產生則需國家行政機關的確認。
3、在權利的標的物方面，著作權的標的物爲文學、藝術和科學等作品，商標權的標的物爲使用於商品或服務的商標。
4、在權利的獨佔性方面，著作權中兩人分別獨立完成同樣的作品均可獲得著作權，商標權則具有相當強的排他性，不僅不能出現保護範圍相同的相同商標，而且不能出現保護範圍相同的近似商標。對於馳名商標，權利的獨佔性更爲明顯。
二、著作權保護時間怎麼算?
不同的權利，著作權保護期限起止時間是不一樣的：
(1)作者的署名權、修改權、保護作品完整權的保護期不受限制。
(2)自然人的作品，其發表權的保護期爲作者終生及其死亡後五十年，截止於作者死亡後第五十年的12月31日;如果是合作作品，截止於最後死亡的作者死亡後第五十年的12月31日
(3)法人或者非法人組織的作品、著作權(署名權除外)由法人或者非法人組織享有的職務作品，其發表權的保護期爲五十年，截止於作品創作完成後第五十年的12月31日;法律上規定的權利的保護期爲五十年，截止於作品首次發表後第五十年的12月31日，但作品自創作完成後五十年內未發表的，著作權法不再保護。
(4)視聽作品，其發表權的保護期爲五十年，截止於作品創作完成後第五十年的12月31日，截止於作品首次發表後第五十年的12月31日，但作品自創作完成後五十年內未發表的，法律不再保護。
這兩種權利的保護對象不同，不同的著作權，保護的期限不一樣，攝影作品、電影作品著作權的保護期限是50年，法人或其他組織的作品，著作權的保護期限是50年，個人文學作品著作權保護期限是作者的一生及死後50年。
