公司的知識產權保護有商標權、專利權、著作權、商業祕密、域名等。公司在與其他單位或個人合作的過程中，一定要對所涉及的知識產權的權屬、使用範圍、期限、後續研發成果的分配等做詳細規定，簽署相關法律檔案，以此來保護應有的知識產權。
法律依據：《專利法》 第十條
中國單位或者個人向外國人、外國企業或者外國其他組織轉讓專利申請權或者專利權的，應當依照有關法律、行政法規的規定辦理手續。轉讓專利申請權或者專利權的，當事人應當訂立書面合同，並向國務院專利行政部門登記，由國務院專利行政部門予以公告。專利申請權或者專利權的轉讓自登記之日起生效。
