股東出資瑕疵的民事責任可分爲兩類：一是有出資瑕疵的股東對公司以及其他股東承擔的民事責任，屬違約責任;二是有出資瑕疵的股東與其他股東對公司債權人的民事責任，即股東違反出資義務，對公司債權人造成損害時，股東對公司的債權人應當承擔的民事法律後果。
1、出資瑕疵股東應當承擔繼續履行出資義務的責任。股東不按期繳納出資的，必須繼續履行足額繳納公司章程中規定的自己所認繳出資額的義務，即使法院受理了公司的破產申請，破產管理人仍然應當要求該股東補足出資，不受出資期限的限制。
2、出資瑕疵股東應當對其他按期足額出資的股東承擔違約責任。不按照約定履行出資義務，已構成違約，無論公司成立與否，都構成對按期足額出資的股東的違約;如果公司已經設立，出資瑕疵股東的行爲同時侵犯了公司的財產權利。公司章程中應當明確規定瑕疵出資的構成條件、承擔違約責任的形式、賠償責任。
《公司法》
第二十八條【出資義務】股東應當按期足額繳納公司章程中規定的各自所認繳的出資額。股東以貨幣出資的，應當將貨幣出資足額存入有限責任公司在銀行開設的帳戶;以非貨幣財產出資的，應當依法辦理其財產權的轉移手續。
股東不按照前款規定繳納出資的，除應當向公司足額繳納外，還應當向已按期足額繳納出資的股東承擔違約責任。
第三十條【出資不足的補充】有限責任公司成立後，發現作爲設立公司出資的非貨幣財產的實際價額顯著低於公司章程所定價額的，應當由交付該出資的股東補足其差額;公司設立時的其他股東承擔連帶責任。
第三十一條 【出資證明書】有限責任公司成立後，應當向股東簽發出資證明書。
出資證明書應當載明下列事項：
(一)公司名稱;
(二)公司成立日期;
(三)公司註冊資本;
(四)股東的姓名或者名稱、繳納的出資額和出資日期;
(五)出資證明書的編號和核發日期。
出資證明書由公司蓋章。
在我們的企業的經營管理的過程中，如果是企業遇到了出資的問題以及股權的瑕疵的時候，一定要及時的瞭解相關的公司法規，此時也是需要按照法定的程序來處理的。
