一、施工合同備案是由業主還是施工單位辦
施工合同備案是由建設單位辦理的。施工合同即建築安裝工程承包合同，是發包人和承包人爲完成商定的建築安裝工程，明確相互權利、義務關係的合同。
《房屋建築和市政基礎設施工程施工招標投標管理辦法》第47條規定“訂立書面合同7日內，中標人應當將合同送縣級以上建設行政主管部門備案;在施工過程中，各級政府建設工程質量監督管理部門還要對工程建設的質量進行全面監督。
施工許可證由建設單位辦理，但是辦理施工許可證之前有許多手續要辦。施工承包中標通知書和承包合同備案，監理中標通知書和監理合同備案，然後是質監、安監，最後是施工許可證。建設單位辦理，施工單位和監理單位配合的。
二、施工合同應包含哪些內容
可以依據國家頒佈的有關合同示範文字擬定建設工程承發包合同專用條款，並特別注意以下條款：
1、工程名稱、地點、範圍和內容;
2、工期，包括整體工程的開、竣工工期以及中間交付工程的開、竣工工期;
3、工程質量保修期及保修條件;
4、工程造價;
5、工程驗收及工程價款的支付、結算方式、支付方式;
6、設計檔案及概算預算、技術資料的提供日期及提供方式;
7、材料的供應及材料進場期限;
8、工程變更;
9、違約、索賠和爭議;
10、當事人約定的其他事項。
三、施工許可證由誰辦理
施工許可證由建設單位辦理，但是辦理施工許可證之前有許多手續要辦。施工承包中標通知書和承包合同備案，監理中標通知書和監理合同備案，然後是質監、安監，最後是施工許可證。建設單位辦理，施工單位和監理單位配合的。
綜合上面所說的，施工合同備案已不再是強制性的，而且國家已取消了此規定，只要在簽訂好合同之後辦理好相關的證件即可施工，如果建設部門未辦理施工許可證就開工，那麼國家是可以認定此建築是屬於違法的，一般是受不到國家的保護。
在進行施工合同備案的時候一般就是根據實際的情況由這個建設單位來進行合同的備案，在進行合同備案的時候也需要準備好相關的材料，然後再根據流程來進行合同的備案，所以在這個時候最好就是提前瞭解清楚。
