港監機構應當以事實爲依據，以法律爲準繩，查明事故原因，判明當事人的責任，作出《水上交通事故責任認定書》，並按法定程序送達事故當事人。發生重大交通事故的，主管港監機構還應當作出《水上交通事故調查報告書》，報送上級主管機關，抄送有關單位。
【法律依據】
《海上交通安全法》第42條，船舶、設施發生交通事故，應當向主管機關遞交事故報告書和有關資料，並接受調查處理。事故的當事人和有關人員，在接受主管機關調查時，必須如實提供現場情況和與事故有關的情節。
《海上交通安全法》第46條，因海上交通事故引起的民事糾紛，可以由主管機關調解處理，不願意調解或調解不成的，當事人可以向人民法院起訴；涉外案件的當事人，還可以根據書面協議提交仲裁機構仲裁。
