第一，無法用專利法保護的，用商業祕密保護，一種是不屬於專利法保護的客體，比如中醫鍼灸方法。二是創造性高度不夠，無法專利授權條件的，這兩種情況用商業祕密保護。
第二，對於公開後容易被競爭對手鬧開的方案，用商業祕密保護，比如中藥配方。
第三，產品生命週期過長或過短的這種方案，不宜用專利保護。由於實用新型專利保護期限爲十年，發明專利的保護期限爲二十年，對於產品生命週期很長的技術方案，保護期限已過就進入公共領域，企業就無法在享有獨佔的權利，不如作爲商業祕密保護，而專利的授權期限，需要至少半年，如果產品生命週期只是一個月以內，就沒必要申請專利保護。
