工程結算和決算的區別主要在於發起對象、清算資料和意義的不同，具體爲：
發起對象不同：工程結算由施工單位發起;工程決算由建設單位發起。
清算資料不同：工程結算包括建築工程費、安裝工程費及合同規定給施工方的其他費用;工程決算包括從籌劃到竣工投產全過程的全部實際費用，即建築工程費、安裝工程費、設備工器具購置費、工程建設其他費用(含徵地費、補償費、各種許可證費、建設單位管理費、監理費、勘查設計費、調試費等等)、預備費、建設期貸款利息等。
意義不同：工程結算是覈定建設工程造價的依據，也是建設項目驗收後編制竣工決算和核定新增固定資產價值的依據;工程決算是反映竣工項目計劃、實際的建設規模、建設工期以及設計和實際的生產能力的重要指標，也是反映概算總投資、實際的建設成本和主要技術經濟的指標。
需要注意的是，兩者的關係是：工程決算是一個工程從無到有的所有相關費用，工程結算是實體工程的建築和安裝工程費用，工程決算包含了工程竣工結算的內容，工程結算是工程決算的重要組成部分。
法律依據：
《中華人民共和國建築法》第十八條
建築工程造價應當按照國家有關規定，由發包單位與承包單位在合同中約定。公開招標發包的，其造價的約定，須遵守招標投標法律的規定。
發包單位應當按照合同的約定，及時撥付工程款項。
