病假扣績效是屬於合法的，首先員工的績效是根據員工工作情況而給予員工的獎勵性待遇，在達標的情況下可以全額領取，員工請假沒有工作，那麼就沒有績效工資。員工在病假期間的工資有法律規定，是不得低於當地最低工資水平的80%。所以沒有扣員工的基本工資就可以了。病假工資或疾病救濟費可以低於當地最低工資標準支付，但不能低於最低工資標準的80%。
《關於貫徹執行<中華人民共和國勞動法>若干問題的意見》勞部發〔1995〕309號
第59條，職工患病或非因工負傷治療期間，在規定的醫療期間內由企業按有關規定支付其病假工資或疾病救濟費，病假工資或疾病救濟費可以低於當地最低工資標準支付，但不能低於最低工資標準的80%。
