刑事案件司法鑑定進行程序：
1、當事人申請鑑定，應當在舉證期限內提出。
2、申請鑑定時，要預交鑑定費用，並提供相關材料。
3、當事人申請鑑定經法院同意後，由雙方當事人協商確定有鑑定資格的鑑定機構、鑑定人員，協商不成時，由人民法院指定。
4、當事人對人民法院委託的鑑定部門作出的鑑定結論有異議申請重新鑑定。
提出證據證明存在下列情形之一的，人民法院應予准許：
(一)鑑定機構或者鑑定人員不具備相關的鑑定資格的。
(二)鑑定程序嚴重違法的。
(三)鑑定結論明顯依據不足的。
(四)經過質證認定不能作爲證據使用的其他情形。
5、對有缺陷的鑑定結論，可以透過補充鑑定、重新質證或者補充質證等方法解決的，不予重新鑑定。
民事訴訟證據規則全文
第二十七條
當事人對人民法院委託的鑑定部門作出的鑑定結論有異議申請重新鑑定，提出證據證明存在下列情形之一的，人民法院應予准許：(一)鑑定機構或者鑑定人員不具備相關的鑑定資格的;(二)鑑定程序嚴重違法的;(三)鑑定結論明顯依據不足的;(四)經過質證認定不能作爲證據使用的其他情形。對有缺陷的鑑定結論，可以透過補充鑑定、重新質證或者補充質證等方法解決的，不予重新鑑定。
