醫療事故醫保報銷的部分有：1、基本醫療保險藥品報銷，包括了甲類和乙類兩種，甲類藥物是能保證臨牀治療基本需要的藥物，這類藥物是可以報銷的，但是乙類很多不可以報銷；2、基本醫療保險診療項目報銷；3、基本醫療服務設施報銷。根據我國《社會保險法》第二十九條，參保人員醫療費用中應當由基本醫療保險基金支付的部分，由社會保險經辦機構與醫療機構、藥品經營單位直接結算。社會保險行政部門和衛生行政部門應當建立異地就醫醫療費用結算制度，方便參保人員享受基本醫療保險待遇。
