(一)本罪與組織他人偷越國(邊)境罪或偷越國(邊)境罪的界限
本罪與其他倆罪的區別一般比較明顯，但在行爲人與組織他人偷越國(邊)境的組織者或偷越國(邊)境的人事前通謀，由行爲人向組織者或偷越國(邊)境的人出售出入境證件的情況下，對行爲人是按非法出售出入境證件罪處理，還是按組織他人偷越國(邊)境罪的共犯處理，實踐中有不同認識。在這種情況下，對行爲人也應按非法出售出入境證件罪論處。在妨害國(邊)境犯罪分工日益精密化的情況下，爲讓所有的犯罪行爲都能得到懲治，本法將各種犯罪行爲都以明確的罪名規定下來，真正做到有法可依。從理論上講，行爲人無論是否和組織者或偷越國(邊)境人通謀，其出售出入境證件的行爲都已構成獨立的犯罪，也沒必要作爲其他犯罪的共犯處理。
(二)本罪與爲組織他人偷越國(邊)境騙取證件罪的界限
(1)犯罪對象不同。本罪的犯罪對象既包括出境證件，也包括入境證件，而後罪的犯罪對象僅包括出境證件。
(2)客觀行爲不同。本罪的行爲特徵是把自己的證件或低價購買的證件出售，而後罪的行爲特徵是弄虛作假，騙取出境證件。
(3)主觀方面有所不同。本罪不要求特定的犯罪目的，而後罪則要求必須有爲組織他人偷越國(邊)境使用的目的。
