首先，兩者的企業性質不同：一人公司是獨立的企業法人，具有完全的民事權利能力，是有限責任公司中的一種特殊類型。而個人獨資企業不具備獨立法人身份。
其次：兩者可以設立主體不同：一人公司的設立主體可以是自然人，也可以是法人。而個人獨資企業的設立主體只能是自然人。
再次：納稅要求不同：一人公司繳納企業所得稅。而個人獨資企業自身不繳納企業所得稅，只待投資者取得投資回報時繳納個人所得稅
最後，最重要的是承擔責任不同：個人獨資企業不具有法人資格，投資人以個人財產對企業債務承擔無限責任。而一人有限公司是獨立的企業法人，股東僅以其認繳的出資額爲限對公司債務承擔有限責任，通常不會牽涉到股東的其他個人財產，經營風險較小。
法律依據:
《個人獨資企業登記管理辦法》第六條
個人獨資企業的名稱應當符合名稱登記管理有關規定，並與其責任形式及從事的營業相符合。個人獨資企業的名稱中不得使用“有限”、“有限責任”或者“公司”字樣。
