第一個階段是醞釀階段，所謂醞釀階段就是經雙方就合同的主要內容，各個條款，進行協商討論，達成意向性的一個文字方塊架性的協議，這是醞釀討論階段。
第二個階段就是根據醞釀討論階段的情況，由一方起草文字，起草文字交於對方進行修改補充完善，然後交由對方進行審查修改，就是文字的提出與修改階段，這個可以是經過幾個回合，然後各方都對合同的主要條款內容，文字這些達成了一致，沒有什麼修改意見了。
第三個階段，就是簽字蓋章階段。簽字蓋章階段一般由一方簽字蓋章，送交另一方，進行最後的簽字蓋章。蓋好了章，然後就是互換文字，這就是合同簽訂的整個流程。
二、《民法典》對於運輸合同的規定
第八百零九條 運輸合同是承運人將旅客或者貨物從起運地點運輸到約定地點，旅客、託運人或者收貨人支付票款或者運輸費用的合同。
第八百一十條 從事公共運輸的承運人不得拒絕旅客、託運人通常、合理的運輸要求。
第八百一十一條 承運人應當在約定期限或者合理期限內將旅客、貨物安全運輸到約定地點。
第八百一十二條 承運人應當按照約定的或者通常的運輸路線將旅客、貨物運輸到約定地點。
第八百一十三條旅客、託運人或者收貨人應當支付票款或者運輸費用。承運人未按照約定路線或者通常路線運輸增加票款或者運輸費用的，旅客、託運人或者收貨人可以拒絕支付增加部分的票款或者運輸費用。
第八百一十四條 客運合同自承運人向旅客出具客票時成立，但是當事人另有約定或者另有交易習慣的除外。
第八百一十五條旅客應當按照有效客票記載的時間、班次和座位號乘坐。旅客無票乘坐、超程乘坐、越級乘坐或者持不符合減價條件的優惠客票乘坐的，應當補交票款，承運人可以按照規定加收票款;旅客不支付票款的，承運人可以拒絕運輸。
實名制客運合同的旅客丟失客票的，可以請求承運人掛失補辦，承運人不得再次收取票款和其他不合理費用。
第八百一十六條旅客因自己的原因不能按照客票記載的時間乘坐的，應當在約定的期限內辦理退票或者變更手續;逾期辦理的，承運人可以不退票款，並不再承擔運輸義務。
以上就是我國法律上對於運輸合同的簽訂流程情況，相關事項的處理上，是需要嚴格基於實際的運輸事項來進行處理的，如果對相關情況的處理不清楚的，可以諮詢律師來進行合法的認定，存在異議的可以申請起訴來追究法律責任。
