1.身份性質不同：公務員的身份是行政編，事業單位人員的身份是事業編，行政編的數量佔少數部分，事業編則包括教師、醫生等數量龐大的羣體。
2.職業穩定性不同：公務員不用交失業保險，而事業單位工作人員要交失業保險。同時，事業編實行合同聘用制，簽訂勞動合同，而同等條件下，公務員則不用簽訂勞動合同，也就是說當前的額制度下，事業編與企業職工一樣存在失業的風險。
3.工資待遇不同：公務員有車貼，事業單位的沒有，有部分地區公務員有年終獎，事業的也沒有。還有就是事業編實行績效工資制，未來改革的方向也會向企業的工資管理制度靠攏，個人績效與工資相掛鉤，而公務員則不會面臨這樣的工資變動。
4.職業發展不同：公務員可以提拔晉升，而且當前公務員實行職級過度，工作滿一定年限可以享受科級待遇，而事業編只能靠職稱漲工資，很多人窮盡一生都是初級職稱，與同齡的公務員相比差別很大。
5.考試難易程度不同：公務員考試考申論與行測兩門，而部分地區的事業編考試只要考一張試卷，裏面融合了申論、行測的內容，但是內容相較於公務員考試要簡單些。
法律依據
《公務員法》
第十五條
公務員享有下列權利：
（一）獲得履行職責應當具有的工作條件；
（二）非因法定事由、非經法定程序，不被免職、降職、辭退或者處分；
（三）獲得工資報酬，享受福利、保險待遇；
（四）參加培訓；
（五）對機關工作和領導人員提出批評和建議；
（六）提出申訴和控告；
（七）申請辭職；
（八）法律規定的其他權利。
