員工擅自離職用人單位應當結清工資，但勞動者應賠償損失。
勞動者擅自離職，指勞動者根據用人單位和自身情況擅自離職，而強行解除與用人單位的勞動關係的一種行爲。因辭職或要求解除合同未準，擅自離職或違約出走；未說明原因不辭而別；受優厚待遇誘惑擅自“跳槽”等均屬擅自離職，屬於違法解除合同，按《勞動合同法》第九十條、勞動部《關於實行勞動合同制度若干問題的通知》（勞部發〔1996〕354號）第18條規定，造成用人單位損失的，應當承擔賠償責任。
《勞動合同法》第九十條勞動者違反本法規定解除勞動合同，或者違反勞動合同中約定的保密義務或者競業限制，給用人單位造成損失的，應當承擔賠償責任。
《關於實行勞動合同制度若干問題的通知》第十八條職工解除勞動合同，應當嚴格按照《勞動法》的規定，提前三十日以書面形式向用人單位提出。職工自動離職屬於違法解除勞動合同，應當按照《違反〈勞動法〉有關勞動合同規定的賠償辦法》承擔賠償責任。
