（1）目的不同。行政訴訟的目的是維護和監督行政機關依法行使行政職權，保護公民、法人和其他組織的合法權益。民事訴訟所要解決的是平等主體的公民之間、法人之間、公民和法人之間的財產關係和人身關係。
（2）訴訟主體不同。在行政訴訟中，有一方必定是行政機關，而且它一直處於被告地位，不得反訴；在民事官司中，雙方當事人既可以當原告，也可以當被告，被告可以反訴。
（3）人民法院受理起訴的條件不同。行政官司，有的可直接向人民法院起訴，有的在起訴前必須經過上一級行政機關的複議；而提起民事訴訟則沒有這樣的條件，只要有明確的被告、具體的訴訟請求和事實根據，屬人民法院主管的，就可以起訴。
（4）舉證責任不同。在行政訴訟中，由行政機關承擔對被訴的具體行政行爲的舉證責任，原告不負舉證責任，而在民事訴訟中，誰提出訴訟主張，誰就負有舉證責任。
（5）審理原則不同。法院審理行政案件，不適用調解，必須以判決或裁定的方式結案；而審理民事案件，可以調解。
【法律依據】
《行政訴訟法》第四十六條，公民、法人或者其他組織直接向人民法院提起訴訟的，應當自知道或者應當知道作出行政行爲之日起六個月內提出。法律另有規定的除外。
