存疑不起訴不會有犯罪記錄。犯罪記錄只能由人民法院依法判決，但是如果確實構成犯罪的，人民法院判決生效後，會有犯罪記錄。存疑不起訴說明行爲人並未被法院定罪，也就是無罪之人，自然是沒有案底的。檢察院在證據不足的情況下，對當事人不起訴是保障人權的體現。
《刑事訴訟法》第十二條，未經人民法院依法判決，對任何人都不得確定有罪。
《刑法》第一百條，依法受過刑事處罰的人，在入伍、就業的時候，應當如實向有關單位報告自己曾受過刑事處罰，不得隱瞞。 犯罪的時候不滿十八週歲被判處五年有期徒刑以下刑罰的人，免除前款規定的報告義務。
