一、管轄權的取得不同。訴訟過程中，一方當事人只要向有管轄權的法院起訴，法院依法受理後，另一方必須應訴；而到仲裁委員會申請仲裁，則必須要有仲裁協議，即合同中訂立仲裁條款或糾紛發生前、糾紛發生後雙方當事人達成的請求仲裁的協議。
二、審理者的產生方式不同。訴訟案件的審判庭由法院指定，不能由當事人選擇；而仲裁案件，除雙方當事人可以協商選定仲裁委員會、約定仲裁庭的組成人數外，當事人有權選定仲裁員。
三、開庭審理的原則不同。法院開庭審理一般公開進行，只有某些涉及國家機密或個人隱私的案件，可以不公開審理。仲裁庭審理案件一般不公開進行，以有利於保守當事人之間的商業祕密和維護其商業信譽。
四、審理程序及當事人的能動性不同。訴訟過程中當事人應當嚴格按照訴訟法的規定進行，仲裁過程中當事人則有較大的自由度，幾乎每一步驟當事人都能主動作爲，如約定由3名仲裁員還是一名仲裁員組成仲裁庭，是否開庭審理等等都可由當事人自由選擇，不得強迫。
五、監督程序不同。我國法院實行兩審終審制，對已經發生法律效力的判決，發現確有錯誤，可適用審判監督程序。